Nel 1509 Pacioli pubblicò il De divina proportione, attingendo al Libellus di Piero che con rigore scientifico aveva affrontato lo studio delle proporzioni. L’opera in tre volumi, dedicata a Ludovico Sforza duca di Milano, tratta del rapporto aureo, dei solidi platonici e di altri poliedri.
Pacioli, come i pitagorici, riporta ogni fonte di conoscenza alle leggi matematiche e fra tutte le proporzioni privilegia la sezione aurea che, per le sue molteplici proprietà, definisce “divina proporzione”: «Poichè Dio portò in essere la virtù celestiale, la quinta essenza, e attraverso di essa creò i quattro solidi […] la terra, l'aria, l'acqua e il fuoco […] così la nostra sacra proporzione diede forma al cielo stesso assegnando al dodecaedro […] il solido costruito con dodici pentagoni, che non può essere costruito senza la nostra sacra proporzione […] Siccome Dio propriamente non si può definire né per parole a noi intendere, così questa nostra proporzione non si può mai per numero intendibile assegnare, né per quantità alcuna razionale esprimere, ma sempre occulta e secreta e dai matematici chiamata irrazionale».

Interessato a rivelare il segreto dell’armonia delle forme, si avvalse della collaborazione di Leonardo da Vinci che, con grande virtuosismo, disegnò in prospettiva sessanta poliedri rappresentandoli sia pieni che nella loro struttura in modo da poterne vedere anche la parte posteriore.